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安醫(yī)大一附院團隊 繪制首個中國人群蛋白截斷突變圖譜

2021-08-25 10:40:37 來源:市場星報   編輯:楊蕊   
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市場星報、安徽財經(jīng)網(wǎng)(m.xomn.cn)訊 (記者 馬冰璐)記者日前從安徽醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院獲悉,該院皮膚科、安醫(yī)大皮膚病研究所和皮膚病學教育部重點實驗室孫良丹教授團隊成功繪制了首個大規(guī)模中國人群蛋白截斷突變圖譜,該項成果在國際著名學術期刊《基因組研究》(Genome Research)發(fā)表。

蛋白截斷突變(protein-truncating variant,PTV)是指基因組中包含的終止密碼子、移碼或剪接位點突變等一系列嚴重影響蛋白編碼基因完整性和功能的遺傳變異,對于人類表型多樣性及疾病的發(fā)生發(fā)展有著重要意義。由于特定PTV在人群中的頻率通常極低,且具有較高的人群特異性,對其進行分析需要特定的大樣本人群數(shù)據(jù)及可靠的分析技術,在本研究之前尚未有公開的中國人群PTV圖譜。

此次研究深入分析了10539名健康對照者和9434名銀屑病患者中1320個基因上的PTVs特征,共鑒定了8720個PTV,其中77%是之前從未報道過的,顯示其高度的人群特異性。研究人員通過新型算法,發(fā)現(xiàn)88%的PTV是有害的且受到凈化選擇的影響,顯示了自然選擇對人類遺傳變異的塑造與影響。研究還對所有鑒定得到的PTV進行了詳細的分類與解析,據(jù)此繪制了首個中國人群蛋白截斷突變圖譜,完善了該領域的“中國拼圖”。

該研究發(fā)現(xiàn),與對照組相比銀屑病患者攜帶的PTV更多(P=0.02),顯示其對疾病發(fā)生機制的重要影響。研究人員還通過對中、歐、非三大人群的比較,鑒定出18個在不同人群中分化水平極高的PTV,并推測其可能受到正向選擇作用,進一步凸顯了PTV的人群特異性特征。

本次研究構建了中國人群蛋白截斷突變圖譜,進一步豐富了銀屑病遺傳變異基礎,擴展了對于蛋白截斷變異人群特異性的認識,對中國人群的起源與演化以及疾病遺傳機制的研究具有重要意義。

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